在2023年中国最好独立学院排名中，昆明医科大学海源学院排名全国独立学院的第98名。昆明医科大学海源学院是云南省唯一一所医学类本科独立学院。
2023年昆明医科大学海源学院在全国独立学院的排名为第98名。
| 年份 | 学校名称 | 全国排名 |
| 2023 | 昆明医科大学海源学院 | 98 |
根据全国独立学院的排名，昆明医科大学海源学院2021年排名第96位；2020年全国排名第170位；2019年全国排名第174位。以下是本站整理的往年昆明医科大学海源学院全国排名位次：
| 序号 | 学校名称 | 发布时间 | 星级排名 | 全国排名 | 办学层次 |
| 1 | 昆明医科大学海源学院 | 2022 | 2 | 100 | 区域高水平应用型大学 |
| 2 | 昆明医科大学海源学院 | 2021 | 2 | 96 | 区域高水平民办大学 |
| 3 | 昆明医科大学海源学院 | 2020 | 2 | 170 | 区域高水平独立学院 |
| 4 | 昆明医科大学海源学院 | 2019 | 2 | 174 | 区域高水平独立学院 |
| 5 | 昆明医科大学海源学院 | 2018 | 1 | 174 | 区域知名独立学院 |
| 6 | 昆明医科大学海源学院 | 2017 | 1 | 203 | 区域知名独立学院 |
昆明医科大学海源学院在云南民办大学排名中为第8名，昆明城市学院在云南民办学院排名中为第1名。
| 省排名 | 学校名称 | 星级排名 | 办学层次 |
| 1 | 昆明城市学院 | 6★ | 中国顶尖应用型大学 |
| 2 | 昆明文理学院 | 5★ | 中国一流应用型大学 |
| 3 | 云南大学滇池学院 | 4★ | 中国高水平应用型大学 |
| 4 | 云南工商学院 | 3★ | 区域一流应用型大学 |
| 5 | 昆明理工大学津桥学院 | 4★ | 中国高水平应用型大学 |
| 6 | 云南经济管理学院 | 4★ | 中国高水平应用型大学 |
| 7 | 丽江文化旅游学院 | 4★ | 中国高水平应用型大学 |
| 8 | 昆明医科大学海源学院 | 2★ | 区域高水平应用型大学 |
| 9 | 云南艺术学院文华学院 | 2★ | 区域高水平应用型大学 |
