吉首大学不是211学校，学校地跨吉首市和张家界市两地办学，是国家民族事务委员会与湖南省人民政府省部共建大学，是湖南省国内一流学科建设高校，入选国家中西部高校基础能力建设工程、卓越医生教育培养计划、卓越农林人才教育培养计划。
学校学科门类齐全，现有教学学院21个，一级学科41个，本科专业78个，覆盖了12大学科门类。有省重点学科5个（其中优势特色重点学科1个）、省国内一流建设学科1个、省国内一流培育学科1个、国家民委重点学科2个；有博士后科研流动站2个，“博士后科研流动站协作研发中心”1个；
有一级学科博士点1个，一级学科硕士点15个，专业硕士点13个;有国家级特色专业3个，国家级本科专业综合改革试点专业1个，“卓越医生教育培养计划”专业1个，“卓越农林人才教育培养计划”专业1个；有国家级一流本科专业建设点8个、省级一流本科专业建设点32个。
有国家地方联合工程实验室、国家级实验教学示范中心、国家级工程实践教育中心等教学、科研平台共30余个。
(1)第四轮学科评估结果：哲学、体育学、民族学、生态学获评C类学科;
(2)国家级特色专业：音乐学、生物科学、工商管理;
(3)国家级综合改革试点专业：软件工程
(4)省级特色专业：新闻学、体育教育、音乐学、舞蹈学、食品科学与工程、生物科学、工商管理、市场营销
