云南二级建造师的变更流程主要包括以下几个步骤：

1.登录系统：首先，需要登录云南省建设注册管理系统（企业版）。该系统是专门为建筑行业从业人员和企业提供服务的在线平台，用于处理各类注册、变更等业务。

2.填写信息：在系统中找到“建造师管理”模块，点击进入后选择“变更注册”选项。根据提示填写相关信息，包括建造师的基本信息、新的聘用单位信息等。请确保所填信息的准确性，以免影响变更进程。

3.上传材料：按照系统要求上传相关材料，通常包括建造师的身份证扫描件、原聘用单位的解聘证明、新聘用单位的劳动合同等。这些文件需清晰完整，以便审核人员查验。

4.提交申请：确认所填信息和上传的材料无误后，点击“提交申请”按钮。系统会生成一份《云南省二级建造师变更注册申请表》，打印出来并由建造师本人签字确认。

5.上报资料：将打印出来的申请表及其他相关纸质材料一并报送至新聘用单位所在地的市级建设行政主管部门。注意，不同地区可能会有不同的具体要求和流程，因此建议提前咨询当地主管部门。

6.审核与公示：市级建设行政主管部门收到材料后，会对材料进行审核。审核通过后，会将信息上报至省级建设行政主管部门。省级部门会对上报的信息进行公示，公示期为10个工作日。公示期间无异议的，视为变更成功。

7.完成变更：公示期结束后，省级建设行政主管部门会在系统中更新建造师的注册信息。至此，二级建造师的变更流程基本完成。建造师可以登录系统查看自己的最新注册状态。

注意事项：

-在整个变更过程中，务必保持与新旧聘用单位的沟通，确保所有手续和材料的准备无误。

-若在变更过程中遇到问题，应及时向相关部门咨询，避免影响变更进度。

-变更成功后，建造师应妥善保管好自己的执业资格证书和印章，并按照新聘用单位的要求进行工作。