造价工程师在编制工程预算时，通常会预留一部分费用作为预备费。预备费是指在工程施工过程中可能发生的不可预见费用，包括设计变更、材料价格波动、自然灾害等风险因素。预备费的计算方式因地区和项目类型而异，但通常有以下几种方法：

1.百分比法：这是最常用的一种方法，根据工程总造价的一定比例来计算预备费。例如，可以预留工程造价的3%至5%作为预备费。这个比例可以根据历史数据和项目特点进行调整。

2.定额法：这种方法是根据工程项目的具体情况和地区经验来确定预备费的金额。例如，可以参考以往类似项目的实际支出情况，结合当前市场条件，估算出合理的预备费额度。

3.分析法：这种方法需要对工程项目进行详细的风险分析，预测可能出现的问题及其对成本的影响。然后根据这些预测结果来分配预备费。这通常需要专业的造价工程师或风险管理专家来进行。

4.动态跟踪法：在项目实施过程中，定期对项目成本进行跟踪和分析，根据实际发生的情况调整预备费。这种方法能够更准确地反映项目的实际情况，但需要投入较多的时间和精力。

在实际操作中，造价工程师可能会结合以上几种方法来综合确定预备费的金额。需要注意的是，预备费并不是固定不变的，随着项目的进展和市场条件的变化，可能需要对其进行相应的调整。

造价工程师在计算预备费时，需要综合考虑多种因素，如项目规模、复杂程度、历史数据、市场状况等。预备费的设置既要保证项目有足够的资金应对不可预见的支出，又要避免过度预留导致资源浪费。通过合理地计算和调整预备费，可以有效控制项目成本，降低风险，确保项目的顺利进行。