一是与电负性很大的原子A形成强极性键的氢原子。
二是较小半径、较大电负性、含孤电子对、带有部分负电荷的原子B(F、O、N)。如果把氢键结合的情况写成通式，可用X-H…Y表示。通式中X和Y代表F、O、N等电负性大而原子半径较小的非金属原子。X和Y既可以是两种相同的元素，或是两种不同的元素。H的体积小，1个H只能形成一个氢键。由于H的两侧电负性极大的原子的负电排斥，使两个原子在H两侧呈直线排列。只有受其他外力的较大影响，才可能改变方向。氢键的强度和电负性有关，介于化学键和分子间作用力之间。氢键的键能比较小，通常只有17～25kJ／mol。氢键的形成对物质的性质有显著的影响，例如，使物质的熔点和沸点升高；溶质与溶剂之间形成氢键，使溶解度增大；如果某种液体的分子间存在氢键，这种液体一般黏度较大，因为分子间可形成众多的氢键。氢键可能导致缔合现象的发生从而使液体的密度增大。在核磁共振谱中，氢键使有关质子的化学位移向低场；在红外光谱中，氢键X-H…Y的形成使X-H的特征振动频率变小并伴有带的加宽和强度的增加；氢键的形成决定蛋白质分子的构象(分子的构象是指分子因单键旋转改变了其原子或原子团在空间的相对位置而呈现的不同立体形象)，在生物体中起重要的作用。
