一般情况下，黄鳝在体长20厘米以上时就进入了性成熟，此时它们就要准备繁殖了，与其他的鱼类一样，黄鳝也是体外受精的，不过，黄鳝有自己的独到之处。
首先，黄鳝的繁殖期集中在每年的6-8月份，此时一旦找到适合繁殖的个体很快就会确立关系，然后雌雄黄鳝就会在自己的洞穴附近寻找一个位置开始吐泡泡，用泡泡将水面上的一些杂物聚集起来形成一个巢，然后才将卵产在气泡之上，这一点与黑鱼的繁殖习性非常的相似。这种繁殖习性的好处就是可以将自己的卵固定在一块，同时泡泡还能起到一定的隐蔽作用，有利于提高卵的成活率，研究表面在泡泡中的卵孵化率平均要在85.2％以上。其次，大多数鱼类产完卵后就离开了，但黄鳝不同，它们会有护卵习性，不过，护卵的并不是黄鳝夫妇，而是其中一个，根据科学的研究发现，守护卵的黄鳝有61.3％的为雄性；38.7％的是兼性偏雄性，这与我们普遍的认知“母亲守护孩子”不同。为了弄清楚黄鳝护卵的好处，科学家们做了一个实验，在卵孵化后（黄鳝依然有护仔行为），将成年黄鳝拿走，与没有拿走的进行对比发现，有黄鳝保护的仔鱼成活率高达64％，而没有黄鳝保护的仔鱼成活率只有14％。因此，虽然6-8月的黄鳝是最肥美的，但从科学的角度看，这几个月份并不适合抓黄鳝，因为在此期间去过度的捕杀，不但会让黄鳝的繁殖量变小（恰好是繁殖期），还会因为亲鱼被人为的抓走，大大降低卵和仔鱼的孵化率和成活率，不利于可持续发展，而这也是如今黄鳝比以前少了很多的重要原因之一。
