复旦大学校区主要分为两个部分:江湾校区和张江校区。
江湾校区位于上海市杨浦区,占地面积约为207.6公顷,是复旦大学的主校区。该校区建于1905年,是中国近代高等教育的发源地之一。现有人文学院、社会科学院、经济学院、法学院、外国语学院、新闻传播学院、历史学院、哲学系等学院和系部。此外,江湾校区还有图书馆、体育馆、学生活动中心等配套设施。张江校区位于上海市浦东新区张江高科技园区,占地面积约为104公顷。该校区建于2003年,是复旦大学的第二个校区,主要以理工学科为主。现有信息科学与工程学院、生命科学学院、环境科学与工程学院、物理学院、化学系等学院和系部。此外,张江校区还有科技大楼、科技馆等配套设施。