一、小龙虾养殖业存在的主要问题1. 组织化程度不高。
近年来，虽然组建了不少行业协会、养殖合作社，但 组 织 发挥 的 作 用还不够，运作 成 功 的更 是 少 之又 少 。 目前 主 要 还是千家万户的小规模生产，养殖生产仍以粗放式养殖为主，品牌建设和市场营销能力不强。
2. 养殖技术有待进一步提高。小龙虾人工养殖的时间还不足10年，有许多技术问题还没有真正搞清楚（如水质环境、种苗繁育、饵料营养、水质调节、病害防控、适时捕捞等），小龙虾养殖仍在“摸着石头过河”的低水平发展阶段，养殖亩产量低而不稳定，疫病时常发生。尤其是稻田综合种养技术耦合度不高，普遍存在“养虾的不会种稻、种稻的不会养虾”的状况，精准化程度不够，水平有待提高。
3.虾苗种繁殖供应滞后。由于小龙虾特有的繁殖生物学习性，规模化苗种繁殖供应还有很大难度，养殖者大都是采取自繁自育模式解决苗种来源，繁苗量化难度大，不可控的情况时有发生。小龙虾规模化的养殖业需要大量优质高产的苗种，而目前专业化商业化育苗体系、品种改良体系严重匮乏，自繁自育技术水平参差不齐，缺乏繁育技术规范，受到环境、水质、异常气候等诸多因素制约。
4.疾病暴发风险加大。由于在小龙虾病理和病原、快速诊断技术、防治药物等相关基础研究较薄弱，不系统和不同步，造成了目前小龙虾病害时有发生的状况，如“望病兴叹”的“五月瘟”问题没有根本性的解决方案。因此，亟待建立小龙虾病害相关疫病预警预报、快速检测、病害防治的绿色防控体系，养殖用药规范化管理有待加强。
5. 饲料营养缺乏系统研究。目前，小龙虾饲料业虽然发展也较快，具备了一定的生产和销售规模，但小龙虾饲料生产企业基本是以河蟹用饲料生产为主，缺少严格意义上的小龙虾营养需求和配方研究。另外市场上小龙虾饲料价格较高，应用情况不够理想。
6. 质量安全监测有待加强。“洗虾粉”、食用小龙虾导致“哈夫病”等事件使公众对小龙虾的食用安全性产生怀疑和恐慌，安全的忧患依然存在，仍不可摆脱小龙虾可造成食品安全隐患的质疑。此外，稻田中的农药也会在小龙虾体内积累，导致农药残留的安全隐患。因此，有必要对小龙虾的食品安全进行科学，系统的研究与评估。
