蓝藻的颜色表现出来的是蓝绿色。
当然，蓝藻中也有含藻红素为主的个别种类，这时，蓝藻的颜色就是红色的，红海中就生长着大量的红色蓝藻，而使得海水呈现红色，红海也因此而得名。 至于绿藻颜色和种类很多,有绿色,也有黄绿色,黄色,金黄色 蓝藻是藻类生物，叶绿素a和藻蓝素量较大,细胞大多呈蓝绿色,又叫蓝绿藻；大多数蓝藻的细胞壁外面有胶质衣，因此又叫粘藻。在所有藻类生物中，蓝藻是最简单、最原始的一种。
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