PCR模板制备是PCR实验的首要步骤，模板制备是从待分析样本中纯化和浓缩核酸（DNA或RNA）以作为PCR扩增模板的过程。
由于PCR用途多样，用于提取核酸的材料可能是全血、动植物组织、培养细胞、口腔涂片、体液、甚至是1700万年前到2000万年前的木兰叶化石。对于不同类型的样本，需要利用不同的方法进行核酸提取
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