生物消毒法是利用一些生物及其产生的物质来杀灭或清除病原微生物的方法。
生物消毒法主要用于水，土壤和生物体表面消毒处理。用作消毒的生物主要有：1、抗菌生物：就是指植物为了保护自身免受外界微生物的侵袭产生的抗菌物质。
2、细菌：当前用于消毒的细菌主要是噬菌蛭弧菌。例如：传统的污水净化可通过缺氧条件下厌氧微生物的生长来阻碍需氧微生物的存活；粪便垃圾的发酵堆肥，可利用噬热细菌繁殖时产生的热杀灭病原微生物。
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