对标准氨基酸化学性质的认识是理解生物化学的中心,根据R基团的不同性质将氨基酸分类可使这一问题简化。
按照R基团的极性(polarity)或在生理pH(接近pH7.0)下与水相互作用的趋势等可将它们分为非极性、极性不带电、带正电(碱性)、带负电(酸性)R基团的氨基酸。
20种蛋白质氨基酸在结构上的差别取决于侧链基团R的不同。通常根据R基团的化学结构或性质将20种氨基酸进行分类1、非极性氨基酸(疏水氨基酸):8种,丙氨酸(Ala)缬氨酸(Val)亮氨酸(Leu)异亮氨酸(Ile)苯丙氨酸(Phe)甲硫氨酸(Met) 脯氨酸(Pro)色氨酸(Trp)2、极性氨基酸(亲水氨基酸):1)极性不带电荷/极性中性氨基酸:苏氨酸(Thr)丝氨酸(Ser)半胱氨酸(Cys)天冬酰胺(Asn)谷氨酰胺(Gln)酪氨酸(Tyr)甘氨酸(Gly)2)带正电氨基酸(碱性氨基酸)3种赖氨酸(Lys)精氨酸(Arg)组氨酸(His)3)带负电氨基酸(酸性氨基酸)2种天冬氨酸(Asp)谷氨酸(Glu)