数字PCR的核心思想是将核酸样品平行划分为大规模单分子水平的微反应单元，然后对众多微反应单元内的靶序列进行扩增和光学检测，实现绝对定量和痕量分析。
该技术的诞生和发展为核酸精确测定和基因分析提供了全新的思路，并具有比传统实时荧光定量PCR技术更好的精确性和灵敏度。目前，该技术已经在肿瘤个体化诊疗、基因编辑、液体活检等前沿生命科学研究、临床医学检验及生物医学检测等多个领域实现突破性应用和发展。
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