1、做良心药俗话说：药材好，药才好。
自古以来，同仁堂选药的标准就是：地道、纯洁、上等。这种求真勿滥的精神，一直延续至今。例如，人参用吉林的，山药用河南的，枸杞用宁夏的，陈皮用广东新会的，丹皮用安徽芜湖的。僵蚕不能用僵蛹代替，16头的人参不能用32头的小人参代替。即便是做大蜜丸的蜂蜜，也必须用河北兴隆的枣花蜜。同时，还要用药材最有效的部位，并且在药材有效成分最多的时候采摘。如七珍丹中的寒食，必须在春天柳树发芽时制造，此所谓“取其地，采其时”。近年来，为了保证原料质量，同仁堂在全国建立了12个药材基地。
2、做仁爱药北京同仁堂颗粒车间，师傅们拿着天平称量人工牛黄和水牛角粉的重量。为了保证天平的平衡，他们不厌其烦地将盘上的药粉增增减减，直到两味药的配比分毫不差。原来，一个批次的人工牛黄和水牛角粉是按总量来料，需要细分下料。到了筛选环节，制药师傅用10目至80目的筛子将半成品反复过筛，将过大过小的颗粒统统去掉。这就是小儿清热颗粒的生产过程。北京同仁堂集团党委书记、董事长梅群说，“以义为先，义利共生”，这是同仁堂的古训，也是同仁堂的价值观。只要利不要义的企业，一个个都倒下了，而同仁堂却屹立百年不倒，其中道理就在于此。“但愿世间人无病，哪怕架上药生尘”。同仁堂，一个“仁”字，写在牌匾上，也刻在人心里。
3、做创新药著名的安宫牛黄丸、牛黄清心丸等，都少不了牛黄。然而，牛黄的天然资源稀少，价格飙升，甚至比金子还贵。1957年，同仁堂试制成功人工牛黄，完全替代了天然牛黄，大幅降低成本，深受百姓欢迎。虎骨酒是治疗风湿的良药，也是同仁堂的古老名药。但是，中国加入保护野生动物国际公约后，虎骨不能使用了。为此，科研人员积极探索与虎骨有同样功能的产品。经过努力，科研人员发现青海高原有一种高原鼢鼠，其骨骼不仅对关节炎有明显的预防和治疗作用，而且能够镇痛和促进骨折愈合，增强机体抗疲劳及抗冻伤，其药效与虎骨相当。根据这一研究成果，同仁堂历经8年时间，开发出塞隆风湿酒，因为高原鼢鼠在当地又被称为塞隆。这是我国第一个动物类一类新药。
