中枢免疫器官与外周免疫器官的区别主要体现在概念、组成器官和作用方面：一、概念不同：中枢免疫器官主要包括骨髓和胸腺，它们是免疫细胞产生、发育、分化和成熟的基地，可以增加机体的免疫力。
而外周免疫器官又叫次级淋巴器官，包括脾脏、淋巴结和黏膜相关淋巴组织等。外周免疫器官是成熟淋巴细胞定居的场地，也是细胞对外来入侵病原体免疫应答的主要场所。
二、组成器官不同：中枢免疫器官主要包括骨髓和胸腺，它们是免疫细胞的发源地和发育场所。外周免疫器官包括脾脏、淋巴结和黏膜相关淋巴组织等，这些器官是成熟淋巴细胞分布和活动的地方。
三、作用不同：
1. 中枢免疫器官：骨髓对造血细胞的生长、分化等可以起到调节的功能，同时骨髓中每个阶段的细胞也在不断完成更新、分化、成熟等过程，中枢免疫器官对外周免疫器官的发育也有一定作用。一旦中枢免疫器官受到损伤，对人体健康会造成很严重的危害。
2. 外周免疫器官：脾脏能够制造血、清除血液中的病毒以及储存更多血液，还能发挥免疫功能产生相关的抗体，以抵抗外来病毒细菌的侵犯。外周免疫器官中的淋巴结是人体重要的免疫器官，一旦发现细菌或病毒侵犯机体后，淋巴结就会与体内病毒或细菌进行对抗，减少机体发生感染性疾病的可能。外周免疫器官中的黏膜相关淋巴组织可以在局部被病原体入侵时，立刻激活B淋巴细胞分化为浆细胞，从而产生多种类别的抗体，保护局部黏膜免受侵犯。
