南京市的高中生物课程主要使用的是人教版的《普通高中课程标准实验教科书·生物》系列。
这套教材共分为必修和选修两部分，其中必修部分包括《分子与细胞》、《遗传与进化》和《稳态与环境》三册；选修部分则根据学生的兴趣和未来发展的需要，可以选择学习《生物技术实践》或《生物科学与社会》等模块。这些教材注重理论与实践相结合，旨在培养学生的生物学素养和科学探究能力。
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