洋务运动的三只海军舰队是:1、北洋海军 1874年(同治十三年)清政府筹划海防,北洋大臣李鸿章主张在北洋建立水师。
随后开办北洋水师学堂,订购铁甲战舰,修筑旅顺和威海卫(今山东威海市)军港。1885年(光绪十一年)清政府设立海军衙门。1888年编成北洋舰队,共二十二艘,其中铁甲舰九艘。丁汝昌任海军提督,军事训练由英国、德国人主持。1894年9月黄海海战中,中日舰队互有伤亡。因李鸿章下令避战、北洋舰队战法单一训练不足、海军军备不足不适应快速海战的特点等种种原因,1895年初在威海卫被围;2月北洋舰队全部覆没。
2、福建水师 1885年(光绪十一年)清政府设立海军衙门后的三大舰队之一。以福建的马尾作为军港,舰队拥有20余艘军舰,主要由福州船政局建造,部分从西欧进口。1884年7月,中法战争中,法舰开进马尾军港,并向福建水师突然袭击,李鸿章恐抗击不利则影响议和,故下令避战求稳,福建水师装备落后数量也不占优势,仓猝应战投入兵舰11艘、商船19艘,全部被击沉,福建水师全部覆没。
3、南洋水师 1888年(光绪十四年)清政府编成北洋海军时,将广东、福建、台湾、上海的军舰划归南洋大臣统辖,称南洋水师。仅有镜清、南琛等中小型舰船八艘。1895年中日甲午战争中北洋海军在威海卫(今山东威海市)覆没后,南洋水师分编为长江舰队和远洋舰队。