1、养殖户难增收（1）一度时期林麝的市场非常火爆，但是从2014年起，林麝几乎无人问津。
（2）县上及相关部门做了大量工作，主要是因为养殖户难增收的局面没有从根本上扭转，所以就使一些养殖户逐渐产生畏难消极的情绪。
2、种群品质退化（1）凤县从林麝人工繁殖驯养以来，一直都是县内之间进行调配，近两年对外调拨关口有所放开，但外地有想发展的客商人工繁殖驯养许可证很难办理。
（2）这就导致林麝近亲繁殖，品质退化严重，发病率、难产率、死亡率很高，影响规模化发展。
3、疾病防控难圈养的林麝非常容易受细菌、病毒感染，化脓性疾病在一年四季都有发生，呈散发的形式，发病多，病程长，治愈率低，死亡率高。
4、缺乏专业人才（1）凤县有一些林麝的养殖“土专家”，但他们缺乏专业培训、没有报酬待遇，只能凭经验、靠实践摸索，一般能治病、做手术的专业技术人员非常缺乏。
（2）林麝发病时，没有一个专门的统筹协调指挥机构，只能碰运气。
（3）尤其是林麝生产期比较集中，难产率也会很高，如果只有几个会做难产手术的专家根本忙不过来。
5、草料采摘难（1）随着林麝种群规模不断扩大，林麝食用的草料也越来越难采摘，县内又没有专门研制营养成分高的颗粒饲料生产企业。
（2）尤其是在晾晒、储备冬季草料时，由于原料少、缺劳力、晾晒期短、储存量大，养殖户只能去邻近镇、相邻县采摘，而且还要高价收购，这样就会增加饲养成本。
