南京大学和上海交通大学在院校历史、地理位置、特色专业、优势学科、科研实力等各有优势。
如果您倾向于历史深厚的文科研究，希望在古老的江南城市学习，可以选择南京大学的历史学或者中国语言文学专业。如果您更倾向于强大的理工科研能力，希望在经济发展快速的大都市学习，可以选择上海交通大学的机械工程或者电子信息类专业。详细对比如下：
1. 院校历史：南京大学始建于1902年，历史悠久，经历了国家与时代变迁的沉淀，是中国近现代最重要的高等教育与科学研究基地之一。上海交通大学创立于1896年，以"公学"为特色，逐渐发展成为具有"综合、研究、开放"特色的世界知名高等学府。
2.地理位置：南京大学位于南京，这是一个充满历史文化的城市，江南的艺术氛围和生活节奏可能更适合文科或社科专业的学习。而上海交通大学坐落在上海，一个经济发展迅速的国际化大都市，为学习和研究理工科专业提供了更多的实习和就业机会。
3.特色专业：南京大学在文科特别是历史学、中国语言文学等方向具有很强的实力，这两个专业在全国都名列前茅。而上海交通大学则在理工科，特别是机械工程、电子信息等专业方面的教学和研究实力十分突出。
4.优势学科：南京大学在人文科学、社会科学等学科方面具有优势，特别在历史学和中国语言文学等方面有着深厚的研究积累和学术影响力。上海交通大学在工程技术、自然科学等领域独占鳌头，尤其在机械工程和电子信息等方向有着非常高的学术地位。请您根据以上分析，结合自身的兴趣和发展目标，谨慎选择学校和专业。
