古典假说是解释遗传多态的一种理论。
由美国遗传学家穆勒提出。认为绝大多数基因突变是致死、半致死或对生存有害的,当其成为纯合子或与野生型等位基因成为杂合子时,其适应值都低于野生型纯合子。因而,突变基因很快被自然选择所淘汰。如果突变对生存有利(在自然界中是极罕见的),由于正选择作用,该突变基因会迅速在群体中固定,不会形成稳定的遗传多态。如果突变对生存有害,由于负选择作用,该突变基因会迅速从群体中消失。遗传多态是突变在从群体中被完全消除之前,低频度存在于群体中的过渡状态。1955年,杜布赞斯基在提出“平衡假说”的同时,揶揄地称穆勒的上述见解为“古典假说”。