1、教育类别不同：普通大学是高等教育的一种类型，指的是通过统招高考生，高考生通过填报志愿，通过全国统一高考招生考试录取入校学习，毕业发放大学相关学历、学位证书。
中外合作办学是一种教育机构，是中国教育机构与国外教育机构合作开办的以中国公民为招生对象的教育活动，属于教育部引进的项目，虽然毕业获得是硕士学位证书，但硕士学位证书认证后相当于国内的学历证和学位证。
2、招生院校不同：普通大学毕业的学员，报考在职研究生选择的是国内的教育部授予的学历学位授予单位的院校，所获得的国内院校颁发的在职研究生。中外合作办学硕士是中国高校与国外高校合作开办的，毕业颁发的是国外的硕士学位，与留学研究生相同的硕士学位。
3、报考方式不同：普通大学攻读在职研究生，不论是通过什么方式报考的，都需要参加全国统一考试，达到分数标准才可以，完成院校的各项教育任务后，毕业才可以获得在职研究生证书。中外合作办学硕士则不需要参加全国统一考试，只需要参加报考院校自行组织的考试，一般通过后就可以入校学习，顺利毕业就可以获得国外的硕士学位证书。以上就是中外合作办学与普通大学的区别介绍，学员在选择中外合作办学的学校时，一定要深入了解该校的情况，要看合作双方是不是正规院校，受不受到国家承认，所获得的证书能不能受到认可等问题。
