话说当年炎黄二帝争霸，黄帝轩辕氏战胜了炎帝神农氏，成为了华夏的统治者。
但是炎帝昔日手下有五大战将，青龙、白虎、朱雀、玄武以及蚩尤，仍然一心为炎帝报仇，双方僵持不下。然而有一天天帝的女儿天女下凡，结识了轩辕黄帝，并且和他相爱，改变了这个局面。在天女的帮助下，黄帝将青龙白虎朱雀玄武一一击败，然后用神器盘古斧，劈开了一个空间裂缝，将青龙白虎朱雀玄武以及他们的子民都送入了另一个空间，借此巩固自己的政权。但是第五位战将-蚩尤，由于得到了风伯和雨师的帮助，并且持有炎帝留下的武器，黄帝一直对他没有办法。在万般无奈之下，天女决定为他去天庭盗取神剑，并且利用自身的阳气，与风伯雨师相抗衡。 最终，黄帝在神剑和天女的帮助下消灭了蚩尤，在战斗中，那把神剑在消灭了蚩尤的同时也被折断。于是天女和黄帝一起重铸了神剑，因为仙凡有别，为了纪念他们这段注定不会有结果的爱情，天女将这把剑取名为轩辕剑，这把轩辕剑就像他们的孩子一样，见证着他们的爱情。 但是悲剧总在一切都那么美好的时候发生，因为过度使用本身的阳气，天女因此变成了旱魃之体，不能返回天界，同时旱魃之体造成了他们所在的世界一片干旱，民不聊生。于是轩辕黄帝忍痛将天女发配到了另一个空间。 对黄帝充满怨恨的天女到达那个空间以后，又因为她的旱魃之体以及当初结下的仇恨，被青龙白虎朱雀玄武四大战将联合封印了起来，以避免她毁灭这个世界。 但是怨恨的力量是可怕的，千年以后，当初的神器轩辕剑吸收了天地精华，化成了人形，来到了这个空间，解救出了像他母亲一样的天女。然而天女已经不是当初那个天真善良的天女了。她始终无法理解为什么自己在帮助黄帝取得了天下之后，她的爱人会如此地对待她，为什么她付出了一切最后却是这种下场。于是她决定报复，在破坏了青龙白虎朱雀玄武四个国家之后，天女决定回到原来的空间将黄帝的子民全部杀死来报复黄帝对他的背叛。轩辕剑的化身，一直将天女视作母亲的他，最后在情义和道义两难的选择中，他选择了牺牲自己，放弃生命重新化成了轩辕剑，为的只是让天女看到轩辕黄帝在轩辕剑上刻下的铭文，黄帝在晚年的时候在轩辕剑上刻下的自责和思念的铭文。天女在一阵哭泣中选择了重新被封印。 也许黄帝和天女的爱情一开始就注定了是悲剧。天女固然很痛苦，付出了全部换来的只是爱人的离弃。但是，轩辕黄帝又何尝不痛苦呢？面对心爱的人和自己的子民，面对情和义两难的选择，他最终选择了义，因为他是我们华夏大地的祖先-黄帝。
