吉首市辖4个街道、5个镇、7个乡。
石家冲街道 辖：吉首大学、杨家坪、雅溪大学科技园、石家冲、胡麻井、砂子拗、雅溪、马坡岭8个社区。 峒河街道 辖：峒河、新桥、向阳、营庄、光明、五里牌、桐油坪7个社区。 乾州街道 辖：燕子岩、东门、竹园、古城、小溪桥5个社区。 红旗门街道 辖：红旗路、团结、吉首商业城、吉新、大田、香园、荣昌坪7个社区。 矮寨镇 辖：营盘、建兴2个居委会；矮寨、德夯、阳光、小兴寨、联团、德茹、夯腊、吉好、小龙、高筹、补育、阳孟、排兄、幸福、补沙、重武、洽比、岩科、平年、家庭、阳桃、大兴寨22个村委会。 马颈坳镇 辖：老街、新街、火车站3个居委会；溪马、团结、几比、榔木坪、隘口、林农、康营、阳田、合群、米坡、竹寨、枫香、泪比河、红岩排、新湾15个村委会。 河溪镇 辖：下街、上街2个居委会；河溪、马鞍山、阿挪、中岩、农科、张排、岩排、持久、新建、楠木、鱼溪、铁岩、永固13个村委会。 双塘镇 辖：火车站、正方2个居委会；周家寨、大坝、双塘、坨峰、夯家溪、大幸、冲虎、兴田、联合、立新、富强、江丰、联盟、科木寨、琴峰、明丰、阴上17个村委会。 丹青镇 辖：丹青居委会；清明、烟竹、大坪、狗咬、巴夭、排胎、章武、鲫鱼、大兴9个村委会。 吉首乡 辖：林木山、光明、寨龙、坪山坡、大田、小溪、上老、白果坪、振武营、望江坳、樟木溪、岩寨、牛岩、五里牌、溪头、桐油坪、砂子坳、雅溪、新桥、吉新、荣庄21个村委会。 万溶江乡 辖：吉庄、兴隆、双河、兔岩、接丰、金坪、大庭、漩潭、狮子、小庄、小溪桥、营丰、树岩桥、蔬菜、胜利15个村委会。 寨阳乡 辖：寨阳、马坳、曙光、回光、庄稼、栗溪、补点、树耳、矮板、勤丰、坪朗、坪冲、新溪、排乃14个村委会。 已略乡 辖：龙舞、求产、结联、自强、荣华、古者、简台、夯坨、红坪、己略、联林11个村委会。 太坪乡 辖：太坪、马头、英勇、司马、夯古、干田、青岗、新华、深坳、金山、农科11个村委会。 白岩乡 辖：白岩、沙坪、雅致、毛坪、补锅、上坪、桥六、檀木、着落、杨柳、紫金、新村12个村委会。 排绸乡 辖：香花、光坪、标锦、黄腊坪、广群、卡坪、槐花、白云、高寨、河坪、三坪11个村委会。 排吼乡 辖：巴蕉、颜家、七星、把金、茶坪、群力、排杉、中百8个村委会。 社塘坡乡
