该校校徽呈圆形,底色为天蓝,蓝色表示海洋,以海洋象征世界。
核心图案由两部分组成。一部分是类似英文字母“Z”的白色符号,在“Z”形符号中上部的空位上有一颗闪烁的红星,两个符号组合起来,正好是一个中文的“巴”字的象形图案,代表了巴县中学与巴渝文化深厚的联系,而“Z”正是“中”字的第一个字母,合起来就巧妙地表示巴县中学的简称———“巴中”。“Z”形符号“Z”上端尖细,给人以由远而来的视觉感受,表示学校历史源远流长;下端呈射线状,射线是无限延伸的,寓意学校办学面向未来,教育实践探索是无穷的,且象征学校的未来无限美好。“Z”形符号中上部空位的红星,代表科技,代表现代化,寓意学校办学条件面向现代化;同时它也象征巴县中学是长江边的一颗明珠;它还象征每一个巴中人,尤其是莘莘学子,每一个人都是一颗闪亮的星。