奎屯有这两所大学:伊犁师范大学(北校区)和新疆兵团农七师行政学院。
奎屯市地处天山北坡山前冲积扇缘地带,海拔在450~530米。境内无山峦及高峰。地势西南高,东北低,地形自西南向东北倾斜。它南距天山山脉约50公里,西距奎屯河约8公里。地势西南高、东北低,南北由海拔610米降至320米,东西由海拔610米降至460米,地面由南北纵坡降为10-30‰,西东纵坡为3-5‰。奎屯市地处天山地槽构造带北部,山前凹陷区准噶尔盆地南沿,构造运动受华力西、燕山和喜马拉雅山乃至新构造运动的影响强烈。在地层上属北天山华力西褶皱带,地质构造复杂,地层发育变化大。