第二高级中学东莞市第二高级中学创办于1995年,起初只有初中,1999年开始招普通高中。
2003年初中分离办学;2004年易名为东城高级中学,属镇办中学。
2007年收回市教育局;2012年04月下旬正式更名东莞市第二高级中学,属市办高中。在2017年的“广东省一级普通高中”评选中,东莞市第二高级中学更是脱颖而出,成为该批次评选中东莞市的唯一一所入围的普通高中;2017年05月,东莞市第二高级中学正式被授予“广东省一级普通高中”称号。学校位于风景秀丽的东莞市东城区黄旗山北麓。学校教学设施完备,校园环境优美,文化氛围浓厚。几年来,学校确立“以学生发展为本”的办学理念,全面推进素质教育。学校坚持依法办校,以德治校,科研兴校,取得显著成绩。