南京体育学院建校多年来积极推进学科专业建设和教育教学改革,现有17个本科专业,涵盖教育学、文学、管理学、医学、艺术学、工学6个学科门类,有国国家级一流本科专业5个,江苏省高校一流本科专业12个,国家级特色专业建设点3个,教育部“十二五”专业综合改革试点项目2个,江苏省高校特色专业建设点4个,江苏省高校品牌专业建设点3个,江苏省“十二五”高等学校重点专业2个。
学校现已经获批博士学位授予立项建设单位,体育学被批准为江苏高校优势学科建设工程立项学科,博士学位授予立项建设单位;体育学被批准为江苏高校优势学科建设工程立项学科;拥有体育学一级学科硕士学位授予点和教育硕士、体育硕士专业学位授予点。